TY - JOUR AU - Epstein, C. J. AU - Smith, S. A. PY - 1974 DA - 1974// TI - Electrophoretic analysis of proteins synthesized by preimplantation mouse embryos JO - Dev Biol VL - 40 UR - https://doi.org/10.1016/0012-1606(74)90126-2 DO - 10.1016/0012-1606(74)90126-2 ID - Epstein1974 ER - TY - JOUR AU - Weng, D. E. AU - Morgan, R. A. AU - Gearhart, J. D. PY - 1989 DA - 1989// TI - Estimates of mRNA abundance in the mouse blastocyst based on cDNA library analysis JO - Mol Reprod Dev VL - 1 UR - https://doi.org/10.1002/mrd.1080010403 DO - 10.1002/mrd.1080010403 ID - Weng1989 ER - TY - JOUR AU - Ma, J. AU - Svoboda, P. AU - Schultz, R. M. AU - Stein, P. PY - 2001 DA - 2001// TI - Regulation of Zygotic Gene Activation in the Preimplantation Mouse Embryo: Global Activation and Repression of Gene Expression JO - Biol Reprod VL - 64 UR - https://doi.org/10.1095/biolreprod64.6.1713 DO - 10.1095/biolreprod64.6.1713 ID - Ma2001 ER - TY - JOUR AU - Zeng, F. AU - Schultz, R. M. PY - 2003 DA - 2003// TI - Gene expression in mouse oocytes and preimplantation embryos: use of suppression subtractive hybridization to identify oocyte- and embryo-specific genes JO - Biol Reprod VL - 68 UR - https://doi.org/10.1095/biolreprod.102.007674 DO - 10.1095/biolreprod.102.007674 ID - Zeng2003 ER - TY - JOUR AU - Misirlioglu, M. AU - Page, G. P. AU - Sagirkaya, H. AU - Kaya, A. AU - Parrish, J. J. AU - First, N. L. AU - Memili, E. PY - 2006 DA - 2006// TI - Dynamics of global transcriptome in bovine matured oocytes and preimplantation embryos JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 103 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0608247103 DO - 10.1073/pnas.0608247103 ID - Misirlioglu2006 ER - TY - JOUR AU - Li, S. S. AU - Liu, Y. H. AU - Tseng, C. N. AU - Singh, S. PY - 2006 DA - 2006// TI - Analysis of gene expression in single human oocytes and preimplantation embryos JO - Biochem Biophys Res Commun VL - 340 UR - https://doi.org/10.1016/j.bbrc.2005.11.149 DO - 10.1016/j.bbrc.2005.11.149 ID - Li2006 ER - TY - JOUR AU - Hamatani, T. AU - Ko, M. AU - Yamada, M. AU - Kuji, N. AU - Mizusawa, Y. AU - Shoji, M. AU - Hada, T. AU - Asada, H. AU - Maruyama, T. AU - Yoshimura, Y. PY - 2006 DA - 2006// TI - Global gene expression profiling of preimplantation embryos JO - Hum Cell VL - 19 UR - https://doi.org/10.1111/j.1749-0774.2006.00018.x DO - 10.1111/j.1749-0774.2006.00018.x ID - Hamatani2006 ER - TY - JOUR AU - Hamatani, T. AU - Carter, M. G. AU - Sharov, A. A. AU - Ko, M. S. PY - 2004 DA - 2004// TI - Dynamics of global gene expression changes during mouse preimplantation development JO - Dev Cell VL - 6 UR - https://doi.org/10.1016/S1534-5807(03)00373-3 DO - 10.1016/S1534-5807(03)00373-3 ID - Hamatani2004 ER - TY - JOUR AU - Goldberg, A. D. AU - Allis, C. D. AU - Bernstein, E. PY - 2007 DA - 2007// TI - Epigenetics: a landscape takes shape JO - Cell VL - 128 UR - https://doi.org/10.1016/j.cell.2007.02.006 DO - 10.1016/j.cell.2007.02.006 ID - Goldberg2007 ER - TY - JOUR AU - Monk, M. AU - Boubelik, M. AU - Lehnert, S. PY - 1987 DA - 1987// TI - Temporal and regional changes in DNA methylation in the embryonic, extraembryonic and germ cell lineages during mouse embryo development JO - Development VL - 99 ID - Monk1987 ER - TY - JOUR AU - Monk, M. AU - Adams, R. L. AU - Rinaldi, A. PY - 1991 DA - 1991// TI - Decrease in DNA methylase activity during preimplantation development in the mouse JO - Development VL - 112 ID - Monk1991 ER - TY - JOUR AU - Santos, F. AU - Peters, A. H. AU - Otte, A. P. AU - Reik, W. AU - Dean, W. PY - 2005 DA - 2005// TI - Dynamic chromatin modifications characterise the first cell cycle in mouse embryos JO - Dev Biol VL - 280 UR - https://doi.org/10.1016/j.ydbio.2005.01.025 DO - 10.1016/j.ydbio.2005.01.025 ID - Santos2005 ER - TY - JOUR AU - Yeo, S. AU - Lee, K. K. AU - Han, Y. M. AU - Kang, Y. K. PY - 2005 DA - 2005// TI - Methylation changes of lysine 9 of histone H3 during preimplantation mouse development JO - Mol Cells VL - 20 ID - Yeo2005 ER - TY - JOUR AU - Torres-Padilla, M. E. AU - Bannister, A. J. AU - Hurd, P. J. AU - Kouzarides, T. AU - Zernicka-Goetz, M. PY - 2006 DA - 2006// TI - Dynamic distribution of the replacement histone variant H3.3 in the mouse oocyte and preimplantation embryos JO - Int J Dev Biol VL - 50 ID - Torres-Padilla2006 ER - TY - JOUR AU - Kimmins, S. AU - Sassone-Corsi, P. PY - 2005 DA - 2005// TI - Chromatin remodelling and epigenetic features of germ cells JO - Nature VL - 434 UR - https://doi.org/10.1038/nature03368 DO - 10.1038/nature03368 ID - Kimmins2005 ER - TY - JOUR AU - Hayashi, K. AU - Yoshida, K. AU - Matsui, Y. PY - 2005 DA - 2005// TI - A histone H3 methyltransferase controls epigenetic events required for meiotic prophase JO - Nature VL - 438 UR - https://doi.org/10.1038/nature04112 DO - 10.1038/nature04112 ID - Hayashi2005 ER - TY - JOUR AU - Holliday, R. AU - Pugh, J. E. PY - 1975 DA - 1975// TI - DNA modification mechanisms and gene activity during development JO - Science VL - 187 UR - https://doi.org/10.1126/science.1111098 DO - 10.1126/science.1111098 ID - Holliday1975 ER - TY - JOUR AU - Sulewska, A. AU - Niklinska, W. AU - Kozlowski, M. AU - Minarowski, L. AU - Naumnik, W. AU - Niklinski, J. AU - Dabrowska, K. AU - Chyczewski, L. PY - 2007 DA - 2007// TI - Detection of DNA methylation in eucaryotic cells JO - Folia Histochem Cytobiol VL - 45 ID - Sulewska2007 ER - TY - CHAP AU - Lister, R. AU - O'Malley, R. C. AU - Tonti-Filippini, J. AU - Gregory, B. D. AU - Berry, C. C. AU - Millar, A. H. AU - Ecker, J. R. PY - 2008 DA - 2008// BT - Highly Integrated Single-Base Resolution Maps of the Epigenome in Arabidopsis ID - Lister2008 ER - TY - JOUR AU - Li, E. PY - 2002 DA - 2002// TI - Chromatin modification and epigenetic reprogramming in mammalian development JO - Nat Rev Genet VL - 3 UR - https://doi.org/10.1038/nrg887 DO - 10.1038/nrg887 ID - Li2002 ER - TY - JOUR AU - Vassena, R. AU - Schramm, R. D. AU - E Latham, K. PY - 2005 DA - 2005// TI - Species-dependent expression patterns of DNA methyltransferase genes in mammalian oocytes and preimplantation embryos JO - Mol Reprod Dev. VL - 72 UR - https://doi.org/10.1002/mrd.20375 DO - 10.1002/mrd.20375 ID - Vassena2005 ER - TY - JOUR AU - Hata, K. AU - Okano, M. AU - Lei, H. AU - Li, E. PY - 2002 DA - 2002// TI - Dnmt3L cooperates with the Dnmt3 family of de novo DNA methyltransferases to establish maternal imprints in mice JO - Development VL - 129 ID - Hata2002 ER - TY - JOUR AU - Krakauer, D. C. AU - Mira, A. PY - 2000 DA - 2000// TI - Mitochondria and the death of oocytes JO - Nature VL - 403 UR - https://doi.org/10.1038/35000654 DO - 10.1038/35000654 ID - Krakauer2000 ER - TY - JOUR AU - Rougier, N. AU - Bourc'his, D. AU - Gomes, D. M. AU - Niveleau, A. AU - Plachot, M. AU - Pàldi, A. AU - Viegas-Péquignot, E. PY - 1998 DA - 1998// TI - Chromosome methylation patterns during mammalian preimplantation development JO - Genes & Development VL - 12 UR - https://doi.org/10.1101/gad.12.14.2108 DO - 10.1101/gad.12.14.2108 ID - Rougier1998 ER - TY - JOUR AU - Santos, F. AU - Hendrich, B. AU - Reik, W. AU - Dean, W. PY - 2002 DA - 2002// TI - Dynamic Reprogramming of DNA Methylation in the Early Mouse Embryo JO - Developmental Biology VL - 241 UR - https://doi.org/10.1006/dbio.2001.0501 DO - 10.1006/dbio.2001.0501 ID - Santos2002 ER - TY - JOUR AU - Morgan, H. D. AU - Santos, F. AU - Green, K. AU - Dean, W. AU - Reik, W. PY - 2005 DA - 2005// TI - Epigenetic reprogramming in mammals JO - Hum Mol Genet VL - 14 UR - https://doi.org/10.1093/hmg/ddi114 DO - 10.1093/hmg/ddi114 ID - Morgan2005 ER - TY - JOUR AU - Reik, W. PY - 2007 DA - 2007// TI - Stability and flexibility of epigenetic gene regulation in mammalian development JO - Nature VL - 447 UR - https://doi.org/10.1038/nature05918 DO - 10.1038/nature05918 ID - Reik2007 ER - TY - JOUR AU - Arányi, T. AU - Páldi, A. PY - 2006 DA - 2006// TI - The constant variation: DNA methylation changes during preimplantation development JO - FEBS Letters VL - 580 UR - https://doi.org/10.1016/j.febslet.2006.11.018 DO - 10.1016/j.febslet.2006.11.018 ID - Arányi2006 ER - TY - JOUR AU - Young, L. E. AU - Beaujean, N. PY - 2004 DA - 2004// TI - DNA methylation in the preimplantation embryo: the differing stories of the mouse and sheep JO - Animal Reproduction Science VL - 82–83 UR - https://doi.org/10.1016/j.anireprosci.2004.05.020 DO - 10.1016/j.anireprosci.2004.05.020 ID - Young2004 ER - TY - JOUR AU - Shi, W. AU - Dirim, F. AU - Wolf, E. AU - Zakhartchenko, V. AU - Haaf, T. PY - 2004 DA - 2004// TI - Methylation Reprogramming and Chromosomal Aneuploidy in In Vivo Fertilized and Cloned Rabbit Preimplantation Embryos JO - Biol Reprod VL - 71 UR - https://doi.org/10.1095/biolreprod.103.024554 DO - 10.1095/biolreprod.103.024554 ID - Shi2004 ER - TY - JOUR AU - Fulka, H. AU - Mrazek, M. AU - Tepla, O. AU - Fulka, J. J. PY - 2004 DA - 2004// TI - DNA methylation pattern in human zygotes and developing embryos JO - Reproduction VL - 128 UR - https://doi.org/10.1530/rep.1.00217 DO - 10.1530/rep.1.00217 ID - Fulka2004 ER - TY - JOUR AU - Hirasawa, R. AU - Chiba, H. AU - Kaneda, M. AU - Tajima, S. AU - Li, E. AU - Jaenisch, R. AU - Sasaki, H. PY - 2008 DA - 2008// TI - Maternal and zygotic Dnmt1 are necessary and sufficient for the maintenance of DNA methylation imprints during preimplantation development JO - Genes Dev VL - 22 UR - https://doi.org/10.1101/gad.1667008 DO - 10.1101/gad.1667008 ID - Hirasawa2008 ER - TY - JOUR AU - Kurihara, Y. AU - Kawamura, Y. AU - Uchijima, Y. AU - Amamo, T. AU - Kobayashi, H. AU - Asano, T. AU - Kurihara, H. PY - 2008 DA - 2008// TI - Maintenance of genomic methylation patterns during preimplantation development requires the somatic form of DNA methyltransferase 1 JO - Developmental Biology VL - 313 UR - https://doi.org/10.1016/j.ydbio.2007.10.033 DO - 10.1016/j.ydbio.2007.10.033 ID - Kurihara2008 ER - TY - CHAP AU - Li, X. AU - Ito, M. AU - Zhou, F. AU - Youngson, N. AU - Zuo, X. AU - Leder, P. AU - Ferguson-Smith, A. C. PY - 2008 DA - 2008// BT - A Maternal-Zygotic Effect Gene, Zfp57, Maintains Both Maternal and Paternal Imprints ID - Li2008 ER - TY - JOUR AU - Ko, Y. G. AU - Nishino, K. AU - Hattori, N. AU - Arai, Y. AU - Tanaka, S. AU - Shiota, K. PY - 2005 DA - 2005// TI - Stage-by-stage change in DNA methylation status of Dnmt1 locus during mouse early development JO - J Biol Chem VL - 280 UR - https://doi.org/10.1074/jbc.M413822200 DO - 10.1074/jbc.M413822200 ID - Ko2005 ER - TY - CHAP AU - May, A. AU - Kirchner, R. AU - Muller, H. AU - Hartmann, P. AU - El Hajj, N. AU - Tresch, A. AU - Zechner, U. AU - Mann, W. AU - Haaf, T. PY - 2008 DA - 2008// TI - Multiplex RT-PCR Expression Analysis of Developmentally Important Genes in Individual Mouse Preimplantation Embryos and Blastomeres BT - Biol Reprod ID - May2008 ER - TY - JOUR AU - Kouzarides, T. PY - 2007 DA - 2007// TI - Chromatin Modifications and Their Function JO - Cell VL - 128 UR - https://doi.org/10.1016/j.cell.2007.02.005 DO - 10.1016/j.cell.2007.02.005 ID - Kouzarides2007 ER - TY - JOUR AU - Villar-Garea, A. AU - Imhof, A. PY - 2006 DA - 2006// TI - The analysis of histone modifications JO - Biochimica et Biophysica Acta (BBA) – Proteins & Proteomics VL - 1764 UR - https://doi.org/10.1016/j.bbapap.2006.08.009 DO - 10.1016/j.bbapap.2006.08.009 ID - Villar-Garea2006 ER - TY - JOUR AU - Huang, J. C. AU - Lei, Z. L. AU - Shi, L. H. AU - Miao, Y. L. AU - Yang, J. W. AU - Ouyang, Y. C. AU - Sun, Q. Y. AU - Chen, D. Y. PY - 2007 DA - 2007// TI - Comparison of histone modifications in in vivo and in vitro fertilization mouse embryos JO - Biochem Biophys Res Commun. VL - 354 UR - https://doi.org/10.1016/j.bbrc.2006.12.163 DO - 10.1016/j.bbrc.2006.12.163 ID - Huang2007 ER - TY - JOUR AU - Prigent, C. AU - Dimitrov, S. PY - 2003 DA - 2003// TI - Phosphorylation of serine 10 in histone H3, what for? JO - J Cell Sci VL - 116 UR - https://doi.org/10.1242/jcs.00735 DO - 10.1242/jcs.00735 ID - Prigent2003 ER - TY - JOUR AU - Lehnertz, B. AU - Ueda, Y. AU - Derijck, A. A. AU - Braunschweig, U. AU - Perez-Burgos, L. AU - Kubicek, S. AU - Chen, T. AU - Li, E. AU - Jenuwein, T. AU - Peters, A. H. PY - 2003 DA - 2003// TI - Suv39h-mediated histone H3 lysine 9 methylation directs DNA methylation to major satellite repeats at pericentric heterochromatin JO - Curr Biol VL - 13 UR - https://doi.org/10.1016/S0960-9822(03)00432-9 DO - 10.1016/S0960-9822(03)00432-9 ID - Lehnertz2003 ER - TY - JOUR AU - Kantor, B. AU - Makedonski, K. AU - Shemer, R. AU - Razin, A. PY - 2003 DA - 2003// TI - Expression and localization of components of the histone deacetylases multiprotein repressory complexes in the mouse preimplantation embryo JO - Gene Expression Patterns VL - 3 UR - https://doi.org/10.1016/j.modgep.2003.07.003 DO - 10.1016/j.modgep.2003.07.003 ID - Kantor2003 ER - TY - JOUR AU - Adenot, P. AU - Mercier, Y. AU - Renard, J. AU - Thompson, E. PY - 1997 DA - 1997// TI - Differential H4 acetylation of paternal and maternal chromatin precedes DNA replication and differential transcriptional activity in pronuclei of 1-cell mouse embryos JO - Development VL - 124 ID - Adenot1997 ER - TY - JOUR AU - Santos, F. AU - Peters, A. H. AU - Otte, A. P. AU - Reik, W. AU - Dean, W. PY - 2005 DA - 2005// TI - Dynamic chromatin modifications characterise the first cell cycle in mouse embryos JO - Developmental Biology VL - 280 UR - https://doi.org/10.1016/j.ydbio.2005.01.025 DO - 10.1016/j.ydbio.2005.01.025 ID - Santos2005 ER - TY - JOUR AU - Kourmouli, N. AU - Jeppesen, P. AU - Mahadevhaiah, S. AU - Burgoyne, P. AU - Wu, R. AU - Gilbert, D. M. AU - Bongiorni, S. AU - Prantera, G. AU - Fanti, L. AU - Pimpinelli, S. PY - 2004 DA - 2004// TI - Heterochromatin and tri-methylated lysine 20 of histone H4 in animals JO - J Cell Sci VL - 117 UR - https://doi.org/10.1242/jcs.01238 DO - 10.1242/jcs.01238 ID - Kourmouli2004 ER - TY - JOUR AU - Lepikhov, K. AU - Walter, J. PY - 2004 DA - 2004// TI - Differential dynamics of histone H3 methylation at positions K4 and K9 in the mouse zygote JO - BMC Dev Biol VL - 4 UR - https://doi.org/10.1186/1471-213X-4-12 DO - 10.1186/1471-213X-4-12 ID - Lepikhov2004 ER - TY - JOUR AU - Sarmento, O. F. AU - Digilio, L. C. AU - Wang, Y. AU - Perlin, J. AU - Herr, J. C. AU - Allis, C. D. AU - Coonrod, S. A. PY - 2004 DA - 2004// TI - Dynamic alterations of specific histone modifications during early murine development JO - J Cell Sci VL - 117 UR - https://doi.org/10.1242/jcs.01328 DO - 10.1242/jcs.01328 ID - Sarmento2004 ER - TY - JOUR AU - Feldman, N. AU - Gerson, A. AU - Fang, J. AU - Li, E. AU - Zhang, Y. AU - Shinkai, Y. AU - Cedar, H. AU - Bergman, Y. PY - 2006 DA - 2006// TI - G9a-mediated irreversible epigenetic inactivation of Oct-3/4 during early embryogenesis JO - Nat Cell Biol VL - 8 UR - https://doi.org/10.1038/ncb1353 DO - 10.1038/ncb1353 ID - Feldman2006 ER - TY - JOUR AU - Erhardt, S. AU - Su, I. -. h. AU - Schneider, R. AU - Barton, S. AU - Bannister, A. J. AU - Perez-Burgos, L. AU - Jenuwein, T. AU - Kouzarides, T. AU - Tarakhovsky, A. AU - Surani, M. A. PY - 2003 DA - 2003// TI - Consequences of the depletion of zygotic and embryonic enhancer of zeste 2 during preimplantation mouse development JO - Development VL - 130 UR - https://doi.org/10.1242/dev.00625 DO - 10.1242/dev.00625 ID - Erhardt2003 ER - TY - JOUR AU - Witt, O. AU - Deubzer, H. E. AU - Milde, T. AU - Oehme, I. PY - 2009 DA - 2009// TI - HDAC family: What are the cancer relevant targets? JO - Cancer Letters VL - 277 UR - https://doi.org/10.1016/j.canlet.2008.08.016 DO - 10.1016/j.canlet.2008.08.016 ID - Witt2009 ER - TY - JOUR AU - Puschendorf, M. AU - Terranova, R. AU - Boutsma, E. AU - Mao, X. AU - Isono, K. -. i. AU - Brykczynska, U. AU - Kolb, C. AU - Otte, A. P. AU - Koseki, H. AU - Orkin, S. H. PY - 2008 DA - 2008// TI - PRC1 and Suv39h specify parental asymmetry at constitutive heterochromatin in early mouse embryos JO - Nat Genet VL - 40 UR - https://doi.org/10.1038/ng.99 DO - 10.1038/ng.99 ID - Puschendorf2008 ER - TY - JOUR AU - Dodge, J. E. AU - Kang, Y. -. K. AU - Beppu, H. AU - Lei, H. AU - Li, E. PY - 2004 DA - 2004// TI - Histone H3-K9 Methyltransferase ESET Is Essential for Early Development JO - Mol Cell Biol VL - 24 UR - https://doi.org/10.1128/MCB.24.6.2478-2486.2004 DO - 10.1128/MCB.24.6.2478-2486.2004 ID - Dodge2004 ER - TY - JOUR AU - Ma, P. AU - Schultz, R. M. PY - 2008 DA - 2008// TI - Histone deacetylase 1 (HDAC1) regulates histone acetylation, development, and gene expression in preimplantation mouse embryos JO - Dev Biol VL - 319 UR - https://doi.org/10.1016/j.ydbio.2008.04.011 DO - 10.1016/j.ydbio.2008.04.011 ID - Ma2008 ER - TY - JOUR AU - Logie, C. AU - Peterson, C. L. PY - 1997 DA - 1997// TI - Catalytic activity of the yeast SWI/SNF complex on reconstituted nucleosome arrays JO - EMBO J VL - 16 UR - https://doi.org/10.1093/emboj/16.22.6772 DO - 10.1093/emboj/16.22.6772 ID - Logie1997 ER - TY - JOUR AU - Bultman, S. J. AU - Gebuhr, T. C. AU - Pan, H. AU - Svoboda, P. AU - Schultz, R. M. AU - Magnuson, T. PY - 2006 DA - 2006// TI - Maternal BRG1 regulates zygotic genome activation in the mouse JO - Genes Dev VL - 20 UR - https://doi.org/10.1101/gad.1435106 DO - 10.1101/gad.1435106 ID - Bultman2006 ER - TY - JOUR AU - Sun, F. AU - Tang, F. AU - Yan, A. Y. AU - Fang, H. Y. AU - Sheng, H. Z. PY - 2007 DA - 2007// TI - Expression of SRG3, a chromatin-remodelling factor, in the mouse oocyte and early preimplantation embryos JO - Zygote VL - 15 UR - https://doi.org/10.1017/S096719940600400X DO - 10.1017/S096719940600400X ID - Sun2007 ER - TY - JOUR AU - Luger, K. AU - Mader, A. W. AU - Richmond, R. K. AU - Sargent, D. F. AU - Richmond, T. J. PY - 1997 DA - 1997// TI - Crystal structure of the nucleosome core particle at 2.8 Å resolution JO - Nature VL - 389 UR - https://doi.org/10.1038/38444 DO - 10.1038/38444 ID - Luger1997 ER - TY - JOUR AU - Palmer, D. K. AU - O'Day, K. AU - Trong, H. L. AU - Charbonneau, H. AU - Margolis, R. L. PY - 1991 DA - 1991// TI - Purification of the centromere-specific protein CENP-A and demonstration that it is a distinctive histone JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 88 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.88.9.3734 DO - 10.1073/pnas.88.9.3734 ID - Palmer1991 ER - TY - JOUR AU - Ahmad, K. AU - Henikoff, S. PY - 2002 DA - 2002// TI - The Histone Variant H3.3 Marks Active Chromatin by Replication-Independent Nucleosome Assembly JO - Molecular Cell VL - 9 UR - https://doi.org/10.1016/S1097-2765(02)00542-7 DO - 10.1016/S1097-2765(02)00542-7 ID - Ahmad2002 ER - TY - JOUR AU - Kamakaka, R. T. AU - Biggins, S. PY - 2005 DA - 2005// TI - Histone variants: deviants? JO - Genes Dev VL - 19 UR - https://doi.org/10.1101/gad.1272805 DO - 10.1101/gad.1272805 ID - Kamakaka2005 ER - TY - JOUR AU - Fu, G. AU - Ghadam, P. AU - Sirotkin, A. AU - Khochbin, S. AU - Skoultchi, A. I. AU - Clarke, H. J. PY - 2003 DA - 2003// TI - Mouse oocytes and early embryos express multiple histone H1 subtypes JO - Biol Reprod VL - 68 UR - https://doi.org/10.1095/biolreprod.102.012336 DO - 10.1095/biolreprod.102.012336 ID - Fu2003 ER - TY - JOUR AU - Chang, C. -. C. AU - Ma, Y. AU - Jacobs, S. AU - Tian, X. C. AU - Yang, X. AU - Rasmussen, T. P. PY - 2005 DA - 2005// TI - A maternal store of macroH2A is removed from pronuclei prior to onset of somatic macroH2A expression in preimplantation embryos JO - Developmental Biology VL - 278 UR - https://doi.org/10.1016/j.ydbio.2004.11.032 DO - 10.1016/j.ydbio.2004.11.032 ID - Chang2005 ER - TY - JOUR AU - Sarma, K. AU - Reinberg, D. PY - 2005 DA - 2005// TI - Histone variants meet their match JO - Nat Rev Mol Cell Biol VL - 6 UR - https://doi.org/10.1038/nrm1567 DO - 10.1038/nrm1567 ID - Sarma2005 ER - TY - JOUR AU - Chadwick, B. P. AU - Willard, H. F. PY - 2001 DA - 2001// TI - A novel chromatin protein, distantly related to histone H2A, is largely excluded from the inactive X chromosome JO - J Cell Biol VL - 152 UR - https://doi.org/10.1083/jcb.152.2.375 DO - 10.1083/jcb.152.2.375 ID - Chadwick2001 ER - TY - JOUR AU - Lee, R. C. AU - Feinbaum, R. L. AU - Ambros, V. PY - 1993 DA - 1993// TI - The C. elegans heterochronic gene lin-4 encodes small RNAs with antisense complementarity to lin-14 JO - Cell VL - 75 UR - https://doi.org/10.1016/0092-8674(93)90529-Y DO - 10.1016/0092-8674(93)90529-Y ID - Lee1993 ER - TY - JOUR AU - Wightman, B. AU - Ha, I. AU - Ruvkun, G. PY - 1993 DA - 1993// TI - Posttranscriptional regulation of the heterochronic gene lin-14 by lin-4 mediates temporal pattern formation in C. elegans JO - Cell VL - 75 UR - https://doi.org/10.1016/0092-8674(93)90530-4 DO - 10.1016/0092-8674(93)90530-4 ID - Wightman1993 ER - TY - JOUR AU - Lee, Y. AU - Jeon, K. AU - Lee, J. T. AU - Kim, S. AU - Kim, V. N. PY - 2002 DA - 2002// TI - MicroRNA maturation: stepwise processing and subcellular localization JO - EMBO J VL - 21 UR - https://doi.org/10.1093/emboj/cdf476 DO - 10.1093/emboj/cdf476 ID - Lee2002 ER - TY - JOUR AU - Bartel, D. P. PY - 2004 DA - 2004// TI - MicroRNAs: Genomics, Biogenesis, Mechanism, and Function JO - Cell VL - 116 UR - https://doi.org/10.1016/S0092-8674(04)00045-5 DO - 10.1016/S0092-8674(04)00045-5 ID - Bartel2004 ER - TY - JOUR AU - Murchison, E. P. AU - Partridge, J. F. AU - Tam, O. H. AU - Cheloufi, S. AU - Hannon, G. J. PY - 2005 DA - 2005// TI - Characterization of Dicer-deficient murine embryonic stem cells JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 102 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0505479102 DO - 10.1073/pnas.0505479102 ID - Murchison2005 ER - TY - JOUR AU - Lykke-Andersen, K. AU - Gilchrist, M. J. AU - Grabarek, J. B. AU - Das, P. AU - Miska, E. AU - Zernicka-Goetz, M. PY - 2008 DA - 2008// TI - Maternal Argonaute 2 Is Essential for Early Mouse Development at the Maternal-Zygotic Transition JO - Mol Biol Cell VL - 19 UR - https://doi.org/10.1091/mbc.E08-02-0219 DO - 10.1091/mbc.E08-02-0219 ID - Lykke-Andersen2008 ER - TY - JOUR AU - Yang, Y. AU - Bai, W. AU - Zhang, L. AU - Yin, G. AU - Wang, X. AU - Wang, J. AU - Zhao, H. AU - Han, Y. AU - Yao, Y. Q. PY - 2008 DA - 2008// TI - Determination of microRNAs in mouse preimplantation embryos by microarray JO - Dev Dyn VL - 237 UR - https://doi.org/10.1002/dvdy.21666 DO - 10.1002/dvdy.21666 ID - Yang2008 ER - TY - CHAP AU - Whitehead, J. AU - Pandey, G. K. AU - Kanduri, C. PY - 2008 DA - 2008// TI - Regulation of the mammalian epigenome by long noncoding RNAs BT - Biochimica et Biophysica Acta (BBA) – General Subjects ID - Whitehead2008 ER - TY - JOUR AU - Amaral, P. P. AU - Mattick, J. S. PY - 2008 DA - 2008// TI - Noncoding RNA in development JO - Mamm Genome VL - 19 UR - https://doi.org/10.1007/s00335-008-9136-7 DO - 10.1007/s00335-008-9136-7 ID - Amaral2008 ER - TY - JOUR AU - Houseley, J. AU - Rubbi, L. AU - Grunstein, M. AU - Tollervey, D. AU - Vogelauer, M. PY - 2008 DA - 2008// TI - A ncRNA modulates histone modification and mRNA induction in the yeast GAL gene cluster JO - Mol Cell VL - 32 UR - https://doi.org/10.1016/j.molcel.2008.09.027 DO - 10.1016/j.molcel.2008.09.027 ID - Houseley2008 ER - TY - JOUR AU - Seim, I. AU - Carter, S. AU - Herington, A. AU - Chopin, L. PY - 2008 DA - 2008// TI - Complex organisation and structure of the ghrelin antisense strand gene GHRLOS, a candidate non-coding RNA gene JO - BMC Molecular Biology VL - 9 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2199-9-95 DO - 10.1186/1471-2199-9-95 ID - Seim2008 ER - TY - JOUR AU - Nagano, T. AU - Mitchell, J. A. AU - Sanz, L. A. AU - Pauler, F. M. AU - Ferguson-Smith, A. C. AU - Feil, R. AU - Fraser, P. PY - 2008 DA - 2008// TI - The Air Noncoding RNA Epigenetically Silences Transcription by Targeting G9a to Chromatin JO - Science VL - 322 UR - https://doi.org/10.1126/science.1163802 DO - 10.1126/science.1163802 ID - Nagano2008 ER - TY - JOUR AU - Lewis, A. AU - Green, K. AU - Dawson, C. AU - Redrup, L. AU - Huynh, K. D. AU - Lee, J. T. AU - Hemberger, M. AU - Reik, W. PY - 2006 DA - 2006// TI - Epigenetic dynamics of the Kcnq1 imprinted domain in the early embryo JO - Development VL - 133 UR - https://doi.org/10.1242/dev.02612 DO - 10.1242/dev.02612 ID - Lewis2006 ER - TY - JOUR AU - Verhaagh, S. AU - Schweifer, N. AU - Barlow, D. P. AU - Zwart, R. PY - 1999 DA - 1999// TI - Cloning of the Mouse and Human Solute Carrier 22a3 (Slc22a3/SLC22A3) Identifies a Conserved Cluster of Three Organic Cation Transporters on Mouse Chromosome 17 and Human 6q26-q27 JO - Genomics VL - 55 UR - https://doi.org/10.1006/geno.1998.5639 DO - 10.1006/geno.1998.5639 ID - Verhaagh1999 ER - TY - JOUR AU - Hartman, M. A. AU - Kreiling, J. L. AU - Byrd, J. C. AU - MacDonald, R. G. PY - 2009 DA - 2009// TI - High-affinity ligand binding by wild-type/mutant heteromeric complexes of the mannose 6-phosphate/insulin-like growth factor II receptor JO - FEBS Journal VL - 276 UR - https://doi.org/10.1111/j.1742-4658.2009.06917.x DO - 10.1111/j.1742-4658.2009.06917.x ID - Hartman2009 ER - TY - JOUR AU - Sheardown, S. A. AU - Duthie, S. M. AU - Johnston, C. M. AU - Newall, A. E. AU - Formstone, E. J. AU - Arkell, R. M. AU - Nesterova, T. B. AU - Alghisi, G. C. AU - Rastan, S. AU - Brockdorff, N. PY - 1997 DA - 1997// TI - Stabilization of Xist RNA mediates initiation of X chromosome inactivation JO - Cell VL - 91 UR - https://doi.org/10.1016/S0092-8674(01)80012-X DO - 10.1016/S0092-8674(01)80012-X ID - Sheardown1997 ER - TY - JOUR AU - Huynh, K. D. AU - Lee, J. T. PY - 2003 DA - 2003// TI - Inheritance of a pre-inactivated paternal X chromosome in early mouse embryos JO - Nature VL - 426 UR - https://doi.org/10.1038/nature02222 DO - 10.1038/nature02222 ID - Huynh2003 ER - TY - JOUR AU - Mak, W. AU - Nesterova, T. B. AU - de Napoles, M. AU - Appanah, R. AU - Yamanaka, S. AU - Otte, A. P. AU - Brockdorff, N. PY - 2004 DA - 2004// TI - Reactivation of the paternal X chromosome in early mouse embryos JO - Science VL - 303 UR - https://doi.org/10.1126/science.1092674 DO - 10.1126/science.1092674 ID - Mak2004 ER - TY - JOUR AU - Avner, P. AU - Heard, E. PY - 2001 DA - 2001// TI - X-chromosome inactivation: counting, choice and initiation JO - Nat Rev Genet VL - 2 UR - https://doi.org/10.1038/35047580 DO - 10.1038/35047580 ID - Avner2001 ER - TY - JOUR AU - Lee, J. T. PY - 2003 DA - 2003// TI - Functional intergenic transcription: a case study of the X inactivation centre JO - Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. VL - 358 UR - https://doi.org/10.1098/rstb.2003.1328 DO - 10.1098/rstb.2003.1328 ID - Lee2003 ER - TY - JOUR AU - Navarro, P. AU - Pichard, S. AU - Ciaudo, C. AU - Avner, P. AU - Rougeulle, C. PY - 2005 DA - 2005// TI - Tsix transcription across the Xist gene alters chromatin conformation without affecting Xist transcription: implications for X-chromosome inactivation JO - Genes Dev VL - 19 UR - https://doi.org/10.1101/gad.341105 DO - 10.1101/gad.341105 ID - Navarro2005 ER - TY - JOUR AU - Sado, T. AU - Hoki, Y. AU - Sasaki, H. PY - 2005 DA - 2005// TI - Tsix silences Xist through modification of chromatin structure JO - Dev Cell VL - 9 UR - https://doi.org/10.1016/j.devcel.2005.05.015 DO - 10.1016/j.devcel.2005.05.015 ID - Sado2005 ER - TY - JOUR AU - Sun, B. K. AU - Deaton, A. M. AU - Lee, J. T. PY - 2006 DA - 2006// TI - A transient heterochromatic state in Xist preempts X inactivation choice without RNA stabilization JO - Mol Cell VL - 21 UR - https://doi.org/10.1016/j.molcel.2006.01.028 DO - 10.1016/j.molcel.2006.01.028 ID - Sun2006 ER - TY - JOUR AU - Lee, J. T. PY - 2005 DA - 2005// TI - Regulation of X-chromosome counting by Tsix and Xite sequences JO - Science VL - 309 UR - https://doi.org/10.1126/science.1113673 DO - 10.1126/science.1113673 ID - Lee2005 ER - TY - JOUR AU - Xu, N. AU - Tsai, C. L. AU - Lee, J. T. PY - 2006 DA - 2006// TI - Transient homologous chromosome pairing marks the onset of X inactivation JO - Science VL - 311 UR - https://doi.org/10.1126/science.1122984 DO - 10.1126/science.1122984 ID - Xu2006 ER - TY - JOUR AU - Zhao, J. AU - Sun, B. K. AU - Erwin, J. A. AU - Song, J. -. J. AU - Lee, J. T. PY - 2008 DA - 2008// TI - Polycomb Proteins Targeted by a Short Repeat RNA to the Mouse X Chromosome JO - Science VL - 322 UR - https://doi.org/10.1126/science.1163045 DO - 10.1126/science.1163045 ID - Zhao2008 ER - TY - JOUR AU - Heard, E. PY - 2005 DA - 2005// TI - Delving into the diversity of facultative heterochromatin: the epigenetics of the inactive X chromosome JO - Current Opinion in Genetics & Development VL - 15 UR - https://doi.org/10.1016/j.gde.2005.08.009 DO - 10.1016/j.gde.2005.08.009 ID - Heard2005 ER - TY - JOUR AU - Mlynarczyk-Evans, S. AU - Royce-Tolland, M. AU - Alexander, M. K. AU - Andersen, A. A. AU - Kalantry, S. AU - Gribnau, J. AU - Panning, B. PY - 2006 DA - 2006// TI - X Chromosomes Alternate between Two States prior to Random X-Inactivation JO - PLoS Biol VL - 4 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pbio.0040159 DO - 10.1371/journal.pbio.0040159 ID - Mlynarczyk-Evans2006 ER - TY - JOUR AU - Augui, S. AU - Filion, G. J. AU - Huart, S. AU - Nora, E. AU - Guggiari, M. AU - Maresca, M. AU - Stewart, A. F. AU - Heard, E. PY - 2007 DA - 2007// TI - Sensing X Chromosome Pairs Before X Inactivation via a Novel X-Pairing Region of the Xic JO - Science VL - 318 UR - https://doi.org/10.1126/science.1149420 DO - 10.1126/science.1149420 ID - Augui2007 ER - TY - JOUR AU - Nguyen, D. K. AU - Disteche, C. M. PY - 2006 DA - 2006// TI - Dosage compensation of the active X chromosome in mammals JO - Nat Genet VL - 38 UR - https://doi.org/10.1038/ng1705 DO - 10.1038/ng1705 ID - Nguyen2006 ER - TY - JOUR AU - Lin, H. AU - Gupta, V. AU - VerMilyea, M. D. AU - Falciani, F. AU - Lee, J. T. AU - O'Neill, L. P. AU - Turner, B. M. PY - 2007 DA - 2007// TI - Dosage Compensation in the Mouse Balances Up-Regulation and Silencing of X-Linked Genes JO - PLoS Biol VL - 5 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pbio.0050326 DO - 10.1371/journal.pbio.0050326 ID - Lin2007 ER - TY - JOUR AU - Zhang, J. AU - Tam, W. L. AU - Tong, G. Q. AU - Wu, Q. AU - Chan, H. Y. AU - Soh, B. S. AU - Lou, Y. AU - Yang, J. AU - Ma, Y. AU - Chai, L. PY - 2006 DA - 2006// TI - Sall4 modulates embryonic stem cell pluripotency and early embryonic development by the transcriptional regulation of Pou5f1 JO - Nat Cell Biol VL - 8 UR - https://doi.org/10.1038/ncb1481 DO - 10.1038/ncb1481 ID - Zhang2006 ER - TY - JOUR AU - Nishioka, N. AU - Yamamoto, S. AU - Kiyonari, H. AU - Sato, H. AU - Sawada, A. AU - Ota, M. AU - Nakao, K. AU - Sasaki, H. PY - 2008 DA - 2008// TI - Tead4 is required for specification of trophectoderm in pre-implantation mouse embryos JO - Mechanisms of Development VL - 125 UR - https://doi.org/10.1016/j.mod.2007.11.002 DO - 10.1016/j.mod.2007.11.002 ID - Nishioka2008 ER - TY - JOUR AU - Hattori, N. AU - Nishino, K. AU - Ko, Y. G. AU - Hattori, N. AU - Ohgane, J. AU - Tanaka, S. AU - Shiota, K. PY - 2004 DA - 2004// TI - Epigenetic Control of Mouse Oct-4 Gene Expression in Embryonic Stem Cells and Trophoblast Stem Cells JO - J Biol Chem VL - 279 UR - https://doi.org/10.1074/jbc.M309002200 DO - 10.1074/jbc.M309002200 ID - Hattori2004 ER - TY - JOUR AU - Kuroda, T. AU - Tada, M. AU - Kubota, H. AU - Kimura, H. AU - Hatano, S. Y. AU - Suemori, H. AU - Nakatsuji, N. AU - Tada, T. PY - 2005 DA - 2005// TI - Octamer and Sox elements are required for transcriptional cis regulation of Nanog gene expression JO - Mol Cell Biol VL - 25 UR - https://doi.org/10.1128/MCB.25.6.2475-2485.2005 DO - 10.1128/MCB.25.6.2475-2485.2005 ID - Kuroda2005 ER - TY - JOUR AU - Naoko, H. AU - Yuko, I. AU - Koichiro, N. AU - Naka, H. AU - Jun, O. AU - Shintaro, Y. AU - Satoshi, T. AU - Kunio, S. PY - 2007 DA - 2007// TI - Epigenetic regulation of Nanog gene in embryonic stem and trophoblast stem cells JO - Genes to Cells VL - 12 UR - https://doi.org/10.1111/j.1365-2443.2007.01058.x DO - 10.1111/j.1365-2443.2007.01058.x ID - Naoko2007 ER - TY - JOUR AU - Byrne, M. J. AU - Warner, C. M. PY - 2008 DA - 2008// TI - MicroRNA expression in preimplantation mouse embryos from Ped gene positive compared to Ped gene negative mice JO - J Assist Reprod Genet VL - 25 UR - https://doi.org/10.1007/s10815-008-9211-8 DO - 10.1007/s10815-008-9211-8 ID - Byrne2008 ER - TY - JOUR AU - Whitelaw, E. AU - Martin, D. I. K. PY - 2001 DA - 2001// TI - Retrotransposons as epigenetic mediators of phenotypic variation in mammals JO - Nat Genet VL - 27 UR - https://doi.org/10.1038/86850 DO - 10.1038/86850 ID - Whitelaw2001 ER - TY - JOUR AU - Han, J. S. AU - Szak, S. T. AU - Boeke, J. D. PY - 2004 DA - 2004// TI - Transcriptional disruption by the L1 retrotransposon and implications for mammalian transcriptomes JO - Nature VL - 429 UR - https://doi.org/10.1038/nature02536 DO - 10.1038/nature02536 ID - Han2004 ER - TY - JOUR AU - Beraldi, R. AU - Pittoggi, C. AU - Sciamanna, I. AU - Mattei, E. AU - Spadafora, C. PY - 2006 DA - 2006// TI - Expression of LINE-1 retroposons is essential for murine preimplantation development JO - Mol Reprod Dev VL - 73 UR - https://doi.org/10.1002/mrd.20423 DO - 10.1002/mrd.20423 ID - Beraldi2006 ER - TY - JOUR AU - Dejosez, M. AU - Krumenacker, J. S. AU - Zitur, L. J. AU - Passeri, M. AU - Chu, L. -. F. AU - Songyang, Z. AU - Thomson, J. A. AU - Zwaka, T. P. PY - 2008 DA - 2008// TI - Ronin Is Essential for Embryogenesis and the Pluripotency of Mouse Embryonic Stem Cells JO - Cell VL - 133 UR - https://doi.org/10.1016/j.cell.2008.05.047 DO - 10.1016/j.cell.2008.05.047 ID - Dejosez2008 ER - TY - JOUR AU - Weksberg, R. AU - Shuman, C. AU - Caluseriu, O. AU - Smith, A. C. AU - Fei, Y. -. L. AU - Nishikawa, J. AU - Stockley, T. L. AU - Best, L. AU - Chitayat, D. AU - Olney, A. PY - 2002 DA - 2002// TI - Discordant KCNQ1OT1 imprinting in sets of monozygotic twins discordant for Beckwith-Wiedemann syndrome JO - Hum Mol Genet VL - 11 UR - https://doi.org/10.1093/hmg/11.11.1317 DO - 10.1093/hmg/11.11.1317 ID - Weksberg2002 ER - TY - JOUR AU - Yamazawa, K. AU - Kagami, M. AU - Fukami, M. AU - Matsubara, K. AU - Ogata, T. PY - 2008 DA - 2008// TI - Monozygotic female twins discordant for Silver-Russell syndrome and hypomethylation of the H19-DMR JO - Journal of Human Genetics VL - 53 UR - https://doi.org/10.1007/s10038-008-0329-4 DO - 10.1007/s10038-008-0329-4 ID - Yamazawa2008 ER - TY - JOUR AU - Maarel, S. M. v. a. n. d. e. r. PY - 2008 DA - 2008// TI - Epigenetic mechanisms in health and disease JO - Ann Rheum Dis VL - 67 ID - Maarel2008 ER - TY - JOUR AU - Tost, J. PY - 2009 DA - 2009// TI - DNA Methylation: An Introduction to the Biology and the Disease-Associated Changes of a Promising Biomarker JO - Methods Mol Biol. VL - 507 UR - https://doi.org/10.1007/978-1-59745-522-0_1 DO - 10.1007/978-1-59745-522-0_1 ID - Tost2009 ER - TY - CHAP AU - Krivtsov, A. V. AU - Feng, Z. AU - Lemieux, M. E. AU - Faber, J. AU - Vempati, S. AU - Sinha, A. U. AU - Xia, X. AU - Jesneck, J. AU - Bracken, A. P. AU - Silverman, L. B. PY - 2008 DA - 2008// BT - H3K79 Methylation Profiles Define Murine and Human MLL-AF4 Leukemias ID - Krivtsov2008 ER -