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Table 1 Primers used for quantitative real-time PCR

From: Identification of 2,3,7,8-tetrachlorodibenzo-p-dioxin (TCDD)-inducible genes in human amniotic epithelial cells

Gene Name

Abbreviation

 

Primers

Arylsulfatase B

ARSB

Forward Primer

GTGGTGTGATCTCGGCTCACT

  

Reverse Primer

CGTGGTGGTGTATGCCTGTAAT

Carbohydrate (N-acetylglucosamine 6-O) sulfotransferase 6

CHST6

Forward Primer

GAAACTGAGTCCACCACTTGAGAA

  

Reverse Primer

TTATTGCTCCTAAAGTCTTCGACTTG

Cytochrome P450 1A1

CYP1A1

Forward Primer

AGCGGAAGTGTATCGGTGAGA

  

Reverse Primer

CTGAATTCCACCCGTTGCA

Cytochrome P450 1B1

CYP1B1

Forward Primer

AGCAGGCTTGCCCAGTACATT

  

Reverse Primer

AAATAGGCTACAGCAGCCCAAA

Dehydrogenase/reductase (SDR family) member 2

DHRS2

Forward Primer

TACTCATGCTAGGCTTGAGGAAGA

  

Reverse Primer

CACCAAGAACCCCACATGTTAA

Fucosyltransferase 2 (secretor status included)

FUT2

Forward Primer

CCAGTGTGCATACAGTCATGGA

  

Reverse Primer

CACGGTGCACTATATTCCCTAACTC

GDP-mannose 4,6-dehydratase

GMDS

Forward Primer

GCCAAGGACTATGTGGAGGCTAT

  

Reverse Primer

ACAAATTCCCGGACACTATGGA

Matrix metalloproteinase 9

MMP9

Forward Primer

TTCCAGTACCGAGAGAAAGCCTAT

  

Reverse Primer

GGTCACGTAGCCCACTTGGT

Membrane metallo-endopeptidase

MME

Forward Primer

ATTCCTTTGGGCCTCTGCTT

  

Reverse Primer

TGGGAAGGCAGCATTGGA

Mitochondrial thioredoxin reductase

TXNRD2

Forward Primer

CTGAGGAAACTCTTATCAGAACATTACAC

  

Reverse Primer

GCGACGCGGTGCTACAA

Podocalyxin-like

PODXL

Forward Primer

GCAGAGAGGGCAAGAGTAAAACTG

  

Reverse Primer

GAGTCATCTGTGTCCTCCATGCT

Poly (ADP-ribose) polymerase family, member 12

ZC3HDC1

Forward Primer

TTCTCAGAGTCTCATGGCATCATAGT

  

Reverse Primer

GTCAGAACAACAGGCAGAAGTGA

Stearoyl-CoA desaturase

SCD

Forward Primer

AGGAATGTCCACCATGAACTTGATA

  

Reverse Primer

CACCGCTTCTCCAATGGATT

Ubiquitin-conjugating enzyme E2E 1 (UBC4/5 homolog, yeast)

UBE2E1

Forward Primer

GGTGGGAAGTATTGCCACTCA

  

Reverse Primer

GTGAAACCCCAATTTATGTAGCGTAT

Uridine phosphorylase 1

UPP1

Forward Primer

CGATTAAGAGACAGAGAATCTTGGATTA

  

Reverse Primer

GAAACCCCAAATCAGGCTAACA

Interleukin 12B

IL12B

Forward Primer

GACAAGTAGTTATGGCTAAGGACATGA

  

Reverse Primer

AGGGATTCCAGATTTTCTTTGCA

Distal-less homeo box 2

DLX2

Forward Primer

AGCCTGGACTTGGACACAGAGT

  

Reverse Primer

GGGTTGCTGAGGTCACTGCTA

Early growth response 1

EGR1

Forward Primer

AAGCCAAGCAAACCAATGGT

  

Reverse Primer

ACTCTGACACATGCTCTGAGAATACTG

High mobility group AT-hook 1

HMGA1

Forward Primer

GTCCCCTACTCCCTCTTCACTGT

  

Reverse Primer

ACCTGGACAATAAGTGACTGCATCT

Interferon regulatory factor 7

IFR7

Forward Primer

GCCTGGTCCTGGTGAAGCT

  

Reverse Primer

GAAGCACTCGATGTCGTCATAGA

Interferon-stimulated transcription factor 3, gamma 48 kDa

ISGF3G

Forward Primer

AAGTAGACTCATTCTTCACACGATTGAC

  

Reverse Primer

AGCCAGTGTGTGCGAGGATT

Myeloid/lymphoid or mixed-lineage leukemia (trithorax homolog, Drosophila); translocated to, 10 (MLLT10)

MLLT10

Forward Primer

GACCATTAAAAGCTCACCACTAGAGTTC

  

Reverse Primer

CTGCGGTACTGTCACATCAAAAG

N-myc (and STAT) interactor (NMI)

NMI

Forward Primer

CGTGAAGATCAAATGAGAGACAAACT

  

Reverse Primer

CTCCCGGACTGTCTGTCATAGTC

Nuclear antigen Sp100

SP100

Forward Primer

CAGCTGTTTTGTTGACATTCTGAA

  

Reverse Primer

TGGAAGAAGACTGACCTGGTACCT

Tumor necrosis factor, alpha-induced protein 3

TNFAIP3

Forward Primer

GAGTAAATTGGCCTCTTTGATACACTT

  

Reverse Primer

AGGAGAAGCACGAAACATCGAT

v-maf musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene homolog F (avian)

MAFF

Forward Primer

CCAGAAGGCAGAGGTTGTAGTGA

  

Reverse Primer

AGGAGCCGGGCAATATTTTTTA

GABA-B receptor

GPR51

Forward Primer

TGTGCGTCTGTAACCCTTTGTG

  

Reverse Primer

AATGGGTGAACCTACAGTATCAGTAAGA

Interferon, alpha 1

IFNA1

Forward Primer

TGATGAATGCGGACTCCATCT

  

Reverse Primer

GACAACCTCCCAGGCACAAG

Signal transducer and activator of transcription 1

STAT1

Forward Primer

TTGAGTGGATGATGTTTCGTGAA

  

Reverse Primer

AGAACCTTGTCAAACCCATCTCTT

Solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 1

SLC2A1

Forward Primer

ACCACTGCAACGGCTTAGACTT

  

Reverse Primer

TGGGTAACAGGGATCAAACAGAT

Solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 3

SLC2A3

Forward Primer

TTGCTCTGGGTGGAAGTACGTT

  

Reverse Primer

ACCAAGAAGGGAAAGGGAGACT

Amphiregulin

AREG

Forward Primer

GCTGCCTTTATGTCTGCTGTGA

  

Reverse Primer

CGTTCCTCAGCTTCTCCTTCA

Caveolin 2

CAV2

Forward Primer

CTCATATCCTTTTGAAGGTAGTTGCA

  

Reverse Primer

GGTGATGCTTTAAGGTAATGATTATGC

DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 3

DNALC3

Forward Primer

AAGAAGTTTGACGACGGAGAAGA

  

Reverse Primer

TTGAACCCTTGCCATGAGTTC

Epiregulin

EREG

Forward Primer

CAATGTAACTCCACTGTTCTCCTGAA

  

Reverse Primer

CTGGTGGTGATTGAATTTAGTCTCA

Epithelial membrane protein 1

EMP1

Forward Primer

AACTCTTGTGGTACCTAGTCAGATGGTA

  

Reverse Primer

GCAAAGCAATGCCTGCTTAAC

FLJ20035

FLJ20035

Forward Primer

TAGTCCAGGATAACAGGATGAATGAA

  

Reverse Primer

ACATAGCTCACGCAAGGAAACA

Insulin induced gene 1

INSIG1

Forward Primer

AAGCTTAGAGGAACTTGCCTGTGA

  

Reverse Primer

TACTCCAAGACATTTCCCTCAAAAC

Integrin, alpha 10

ITGA10

Forward Primer

AGTAAAGGCAGTTGGATTCTCATAGAC

  

Reverse Primer

GAGCTGCACTCTGGAGACCAAT

Integrin, alpha 2 (CD49B, alpha 2 subunit of VLA-2 receptor)

ITGA2

Forward Primer

AGATGATTTGGTCAGATTGGGATAAG

  

Reverse Primer

TGGGTGGTGTTTCTCAAAGTGT

Interferon induced transmembrane protein 1

IFITM1

Forward Primer

TCCCTGTTCAACACCCTCTTCT

  

Reverse Primer

GTCACGTCGCCAACCATCTT

Interferon, alpha-inducible protein

G1P2

Forward Primer

CCTGCTGGTGGTGGACAAAT

  

Reverse Primer

CCGCTCACTTGCTGCTTCA

Interferon, alpha-inducible protein 27

IFI27

Forward Primer

TGGCCAGGATTGCTACAGTTG

  

Reverse Primer

TATGGAGGACGAGGCGATTC

Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1

IFIT1

Forward Primer

GAAACTTCGGAGAAAGGCATTAGA

  

Reverse Primer

GCTCATAGTACTCCAGGGCTTCAT

Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 2

IFIT2

Forward Primer

CTTGGAACGATTGAGATTTTCTAGGT

  

Reverse Primer

CCCAGAGTGTGGCTGATGCT

Keratin 6A

KRT6A

Forward Primer

TTCAGAACAACTTCCACTTACTTTCC

  

Reverse Primer

GTCACTTGTGCTTTCATGGATACTG

Low density lipoprotein receptor-related protein 3

LRP3

Forward Primer

CCCATCCTATGGTCAGCTCATC

  

Reverse Primer

CGTGCCGACGCATCTGT

Presenilin 2 (Alzheimer disease 4)

PSEN2

Forward Primer

CACAGCAGGTTTATCCAGATGAAC

  

Reverse Primer

CACTCCCGAGCACACTCTTTG

Ras-related associated with diabetes

RRAD

Forward Primer

TTGAGACATCAGCGGCATTG

  

Reverse Primer

CGTCGTGCGTTGGCTTCT

Serine (or cysteine) proteinase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 2

SERPINB2

Forward Primer

GTGAATGAGGAGGGCACTGAAG

  

Reverse Primer

AGAAAAGGATGATCTGCCACAAAC

Small proline-rich protein 3

SPRR3

Forward Primer

CCATGTCCTTCAACGGTCACT

  

Reverse Primer

AGCATCTGGTGGTTGGCTTCT

Tripartite motif-containing 14

TRIM14

Forward Primer

GCAGAGACAGAGCTAGACTGTAAAGGT

  

Reverse Primer

CCTGGTCACACAATTGATATGGA

Tumor necrosis factor

TNF

Forward Primer

GAATGTGTGGCCTGCACAGT

  

Reverse Primer

CCAGATGTCAGGGATCAAAGC

Chromosome 10 open reading frame 116

C10orf116

Forward Primer

ACAGCCTGGCCCTGATCTC

  

Reverse Primer

GCTTGCGAGGAATCATGAAGT

Pleckstrin homology-like domain, family A, member 1

PHLDA1

Forward Primer

ACGAGCACATTTCTATTGTCTTCACT

  

Reverse Primer

TCGCAAGTTTTCAGTAGGGTGAT