TY - JOUR AU - Dejarnette, J. M. PY - 2005 DA - 2005// TI - The effect of semen quality on reproductive efficiency JO - Vet Clin North Am Food Anim Pract VL - 21 UR - https://doi.org/10.1016/j.cvfa.2005.02.011 DO - 10.1016/j.cvfa.2005.02.011 ID - Dejarnette2005 ER - TY - JOUR AU - Feugang, J. M. AU - Rodriguez-Osorio, N. AU - Kaya, A. AU - Wang, H. AU - Page, G. AU - Ostermeier, G. C. AU - Topper, E. K. AU - Memili, E. PY - 2010 DA - 2010// TI - Transcriptome analysis of bull spermatozoa: implications for male fertility JO - Reprod Biomed Online VL - 21 UR - https://doi.org/10.1016/j.rbmo.2010.06.022 DO - 10.1016/j.rbmo.2010.06.022 ID - Feugang2010 ER - TY - JOUR AU - Bartel, D. P. PY - 2009 DA - 2009// TI - MicroRNAs: target recognition and regulatory functions JO - Cell VL - 136 UR - https://doi.org/10.1016/j.cell.2009.01.002 DO - 10.1016/j.cell.2009.01.002 ID - Bartel2009 ER - TY - JOUR AU - Memili, E. AU - First, N. L. PY - 1999 DA - 1999// TI - Control of gene expression at the onset of bovine embryonic development JO - Biol Reprod VL - 61 UR - https://doi.org/10.1095/biolreprod61.5.1198 DO - 10.1095/biolreprod61.5.1198 ID - Memili1999 ER - TY - JOUR AU - Misirlioglu, M. AU - Page, G. P. AU - Sagirkaya, H. AU - Kaya, A. AU - Parrish, J. J. AU - First, N. L. AU - Memili, E. PY - 2006 DA - 2006// TI - Dynamics of global transcriptome in bovine matured oocytes and preimplantation embryos JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 103 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0608247103 DO - 10.1073/pnas.0608247103 ID - Misirlioglu2006 ER - TY - JOUR AU - Baskerville, S. AU - Bartel, D. P. PY - 2005 DA - 2005// TI - Microarray profiling of microRNAs reveals frequent coexpression with neighboring miRNAs and host genes JO - RNA VL - 11 UR - https://doi.org/10.1261/rna.7240905 DO - 10.1261/rna.7240905 ID - Baskerville2005 ER - TY - JOUR AU - Bouhallier, F. AU - Allioli, N. AU - Lavial, F. AU - Chalmel, F. AU - Perrard, M. H. AU - Durand, P. AU - Samarut, J. AU - Pain, B. AU - Rouault, J. P. PY - 2010 DA - 2010// TI - Role of miR-34c microRNA in the late steps of spermatogenesis JO - RNA VL - 16 UR - https://doi.org/10.1261/rna.1963810 DO - 10.1261/rna.1963810 ID - Bouhallier2010 ER - TY - JOUR AU - Saacke, R. G. PY - 2008 DA - 2008// TI - Sperm morphology: Its relevance to compensable and uncompensable traits in semen JO - Theriogenology VL - 70 UR - https://doi.org/10.1016/j.theriogenology.2008.04.012 DO - 10.1016/j.theriogenology.2008.04.012 ID - Saacke2008 ER - TY - JOUR AU - Zwald, N. R. AU - Weigel, K. A. AU - Chang, Y. M. AU - Welper, R. D. AU - Clay, J. S. PY - 2004 DA - 2004// TI - Genetic selection for health traits using producer-recorded data. II. Genetic correlations, disease probabilities, and relationships with existing traits JO - J Dairy Sci VL - 87 UR - https://doi.org/10.3168/jds.S0022-0302(04)73574-2 DO - 10.3168/jds.S0022-0302(04)73574-2 ID - Zwald2004 ER - TY - JOUR AU - Wang, C. AU - Yang, C. AU - Chen, X. AU - Yao, B. AU - Zhu, C. AU - Li, L. AU - Wang, J. AU - Li, X. AU - Shao, Y. AU - Liu, Y. PY - 2011 DA - 2011// TI - Altered profile of seminal plasma microRNAs in the molecular diagnosis of male infertility JO - Clin Chem VL - 57 UR - https://doi.org/10.1373/clinchem.2011.169714 DO - 10.1373/clinchem.2011.169714 ID - Wang2011 ER - TY - JOUR AU - Peddinti, D. AU - Nanduri, B. AU - Kaya, A. AU - Feugang, J. M. AU - Burgess, S. C. AU - Memili, E. PY - 2008 DA - 2008// TI - Comprehensive proteomic analysis of bovine spermatozoa of varying fertility rates and identification of biomarkers associated with fertility JO - BMC Syst Biol VL - 2 UR - https://doi.org/10.1186/1752-0509-2-19 DO - 10.1186/1752-0509-2-19 ID - Peddinti2008 ER - TY - JOUR AU - Feugang, J. M. AU - Camargo-Rodríguez, O. AU - Memili, E. PY - 2009 DA - 2009// TI - Culture systems for bovine embryos JO - Livest Sci VL - 121 UR - https://doi.org/10.1016/j.livsci.2008.06.019 DO - 10.1016/j.livsci.2008.06.019 ID - Feugang2009 ER - TY - JOUR AU - Sagirkaya, H. AU - Misirlioglu, M. AU - Kaya, A. AU - First, N. L. AU - Parrish, J. J. AU - Memili, E. PY - 2006 DA - 2006// TI - Developmental and molecular correlates of bovine preimplantation embryos JO - Reproduction VL - 131 UR - https://doi.org/10.1530/rep.1.01021 DO - 10.1530/rep.1.01021 ID - Sagirkaya2006 ER - TY - STD TI - Asuragen. Austin, TX, http://www.asuragen.com, UR - http://www.asuragen.com ID - ref14 ER - TY - JOUR AU - Huber, W. AU - von Heydebreck, A. AU - Sultmann, H. AU - Poustka, A. AU - Vingron, M. PY - 2002 DA - 2002// TI - Variance stabilization applied to microarray data calibration and to the quantification of differential expression JO - Bioinformatics VL - 18 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/18.suppl_1.S96 DO - 10.1093/bioinformatics/18.suppl_1.S96 ID - Huber2002 ER - TY - JOUR AU - Rusinov, V. AU - Baev, V. AU - Minkov, I. N. AU - Tabler, M. PY - 2005 DA - 2005// TI - MicroInspector: a web tool for detection of miRNA binding sites in an RNA sequence JO - Nucleic Acids Res VL - 33 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gki364 DO - 10.1093/nar/gki364 ID - Rusinov2005 ER - TY - JOUR AU - Gu, Z. AU - Eleswarapu, S. AU - Jiang, H. PY - 2007 DA - 2007// TI - Identification and characterization of microRNAs from the bovine adipose tissue and mammary gland JO - FEBS Lett VL - 581 UR - https://doi.org/10.1016/j.febslet.2007.01.081 DO - 10.1016/j.febslet.2007.01.081 ID - Gu2007 ER - TY - JOUR AU - Seal, R. L. AU - Gordon, S. M. AU - Lush, M. J. AU - Wright, M. W. AU - Bruford, E. A. PY - 2011 DA - 2011// TI - Genenames.org: the HGNC resources in 2011 JO - Nucleic Acids Res VL - 39 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkq892 DO - 10.1093/nar/gkq892 ID - Seal2011 ER - TY - JOUR AU - Strozzi, F. AU - Mazza, R. AU - Malinverni, R. AU - Williams, J. L. PY - 2009 DA - 2009// TI - Annotation of 390 bovine miRNA genes by sequence similarity with other species JO - Anim Genet VL - 40 UR - https://doi.org/10.1111/j.1365-2052.2008.01780.x DO - 10.1111/j.1365-2052.2008.01780.x ID - Strozzi2009 ER - TY - JOUR AU - Bentwich, I. AU - Avniel, A. AU - Karov, Y. AU - Aharonov, R. AU - Gilad, S. AU - Barad, O. AU - Barzilai, A. AU - Einat, P. AU - Einav, U. AU - Meiri, E. PY - 2005 DA - 2005// TI - Identification of hundreds of conserved and nonconserved human microRNAs JO - Nat Genet VL - 37 UR - https://doi.org/10.1038/ng1590 DO - 10.1038/ng1590 ID - Bentwich2005 ER - TY - JOUR AU - Pfaffl, M. W. AU - Horgan, G. W. AU - Dempfle, L. PY - 2002 DA - 2002// TI - Relative expression software tool (REST) for group-wise comparison and statistical analysis of relative expression results in real-time PCR JO - Nucleic Acids Res VL - 30 UR - https://doi.org/10.1093/nar/30.9.e36 DO - 10.1093/nar/30.9.e36 ID - Pfaffl2002 ER - TY - JOUR AU - Ashburner, M. AU - Ball, C. A. AU - Blake, J. A. AU - Botstein, D. AU - Butler, H. AU - Cherry, J. M. AU - Davis, A. P. AU - Dolinski, K. AU - Dwight, S. S. AU - Eppig, J. T. PY - 2000 DA - 2000// TI - Gene ontology: tool for the unification of biology. The Gene Ontology Consortium JO - Nat Genet VL - 25 UR - https://doi.org/10.1038/75556 DO - 10.1038/75556 ID - Ashburner2000 ER - TY - JOUR AU - Krawetz, S. A. AU - Kruger, A. AU - Lalancette, C. AU - Tagett, R. AU - Anton, E. AU - Draghici, S. AU - Diamond, M. P. PY - 2011 DA - 2011// TI - A survey of small RNAs in human sperm JO - Hum Reprod VL - 26 UR - https://doi.org/10.1093/humrep/der329 DO - 10.1093/humrep/der329 ID - Krawetz2011 ER - TY - JOUR AU - Ikematsu, N. AU - Yoshida, Y. AU - Kawamura-Tsuzuku, J. AU - Ohsugi, M. AU - Onda, M. AU - Hirai, M. AU - Fujimoto, J. AU - Yamamoto, T. PY - 1999 DA - 1999// TI - Tob2, a novel anti-proliferative Tob/BTG1 family member, associates with a component of the CCR4 transcriptional regulatory complex capable of binding cyclin-dependent kinases JO - Oncogene VL - 18 UR - https://doi.org/10.1038/sj.onc.1203193 DO - 10.1038/sj.onc.1203193 ID - Ikematsu1999 ER - TY - JOUR AU - Livak, K. J. AU - Schmittgen, T. D. PY - 2001 DA - 2001// TI - Analysis of relative gene expression data using real-time quantitative PCR and the 2(-Delta Delta C(T)) Method JO - Methods VL - 25 UR - https://doi.org/10.1006/meth.2001.1262 DO - 10.1006/meth.2001.1262 ID - Livak2001 ER - TY - JOUR AU - Bartel, D. P. PY - 2004 DA - 2004// TI - MicroRNAs: genomics, biogenesis, mechanism, and function JO - Cell VL - 116 UR - https://doi.org/10.1016/S0092-8674(04)00045-5 DO - 10.1016/S0092-8674(04)00045-5 ID - Bartel2004 ER - TY - JOUR AU - Hwang, H. W. AU - Wentzel, E. A. AU - Mendell, J. T. PY - 2009 DA - 2009// TI - Cell-cell contact globally activates microRNA biogenesis JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 106 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0811523106 DO - 10.1073/pnas.0811523106 ID - Hwang2009 ER - TY - JOUR AU - Harfe, B. D. PY - 2005 DA - 2005// TI - MicroRNAs in vertebrate development JO - Curr Opin Genet Dev VL - 15 UR - https://doi.org/10.1016/j.gde.2005.06.012 DO - 10.1016/j.gde.2005.06.012 ID - Harfe2005 ER - TY - JOUR AU - Liu, W. M. AU - Pang, R. T. AU - Chiu, P. C. AU - Wong, B. P. AU - Lao, K. AU - Lee, K. F. AU - Yeung, W. S. PY - 2012 DA - 2012// TI - Sperm-borne microRNA-34c is required for the first cleavage division in mouse JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 109 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.1110368109 DO - 10.1073/pnas.1110368109 ID - Liu2012 ER - TY - JOUR AU - Yan, N. AU - Lu, Y. AU - Sun, H. AU - Tao, D. AU - Zhang, S. AU - Liu, W. AU - Ma, Y. PY - 2007 DA - 2007// TI - A microarray for microRNA profiling in mouse testis tissues JO - Reproduction VL - 134 UR - https://doi.org/10.1530/REP-07-0056 DO - 10.1530/REP-07-0056 ID - Yan2007 ER - TY - JOUR AU - Saito, K. AU - Kageyama, Y. AU - Okada, Y. AU - Kawakami, S. AU - Kihara, K. AU - Ishibashi, K. AU - Sasaki, S. PY - 2004 DA - 2004// TI - Localization of aquaporin-7 in human testis and ejaculated sperm: possible involvement in maintenance of sperm quality JO - J Urol VL - 172 UR - https://doi.org/10.1097/01.ju.0000141499.08650.ab DO - 10.1097/01.ju.0000141499.08650.ab ID - Saito2004 ER - TY - JOUR AU - Rix, S. AU - Calmont, A. AU - Scambler, P. J. AU - Beales, P. L. PY - 2011 DA - 2011// TI - An Ift80 mouse model of short rib polydactyly syndromes shows defects in hedgehog signalling without loss or malformation of cilia JO - Hum Mol Genet VL - 20 UR - https://doi.org/10.1093/hmg/ddr013 DO - 10.1093/hmg/ddr013 ID - Rix2011 ER - TY - JOUR AU - Zhao, L. AU - Shi, X. AU - Li, L. AU - Miller, D. J. PY - 2007 DA - 2007// TI - Dynamin 2 associates with complexins and is found in the acrosomal region of mammalian sperm JO - Mol Reprod Dev VL - 74 UR - https://doi.org/10.1002/mrd.20660 DO - 10.1002/mrd.20660 ID - Zhao2007 ER - TY - JOUR AU - Lalancette, C. AU - Thibault, C. AU - Bachand, I. AU - Caron, N. AU - Bissonnette, N. PY - 2008 DA - 2008// TI - Transcriptome analysis of bull semen with extreme nonreturn rate: use of suppression-subtractive hybridization to identify functional markers for fertility JO - Biol Reprod VL - 78 UR - https://doi.org/10.1095/biolreprod.106.059030 DO - 10.1095/biolreprod.106.059030 ID - Lalancette2008 ER - TY - JOUR AU - Bissonnette, N. AU - Levesque-Sergerie, J. P. AU - Thibault, C. AU - Boissonneault, G. PY - 2009 DA - 2009// TI - Spermatozoal transcriptome profiling for bull sperm motility: a potential tool to evaluate semen quality JO - Reproduction VL - 138 UR - https://doi.org/10.1530/REP-08-0503 DO - 10.1530/REP-08-0503 ID - Bissonnette2009 ER -